教育部「大專校院產學合作績效評量」，調查各大專校院推動產學合作之相關成果，提升大學對產學合作推動之重視，分別就學校「爭取產學經費與效率」、「產學合作參與廣泛程度」及「智權產出成果與應用效益」三項主要績效進行評量，崑山科技大學總績效排名，4年均居私立科大之冠。
教育部公布100年度大專校院產學合作績效評量，崑山科技大學在「大專校院開創智財收入」及「大專校院孕育新創企業家數」2項指標，與國立科技大學同列績優校院，更為台南地區唯一兩指標皆達頂標之科技大學，產學合作成果豐碩，表現優異。
今年教育部將行政院2008年推動之「加值產學 (研)合作連結創新計畫」納入，並參考全球高等教育產學合作發展趨勢，將三項指標訂為「大專校院研發經費來自企業金額」、「大專校院開創智財收入」及「大專校院孕育新創企業家數」，崑山科技大學於開創智財收入與孕育新創企業家數，再度表現優異，與國立科技大學同列績優校院，為台南地區唯一兩指標皆達頂標之科技大學。
該校研發長林水木表示，崑山科技大學與近400家廠商進行產學合作，參與教師佔全校教師比例達90%，爭取政府投入之研發經費超過新台幣1億元；同時進駐崑山科技大學育成中心的新創企業家數近50家，協助新創事業，積極推動教師研發成果技術移轉。此外，國家重點發展的文化創意產業，也是崑山科技大學產學合作的重點，崑山科技大學連續五年獲得文化部藝文產業創新育成中心計畫，擴建南部藝文產業合作平台，與安平劍獅埕、十鼓擊樂團、台南人劇團、涴莎室內樂團、府城光彩繡莊、鎮北坊文史工作室等建立夥伴關係，開發更多元的合作模式與商機。
